Soms voert de WOWD zelf toepassingsgericht wetenschappelijk onderzoek uit. Meestal echter wordt een onderzoeksopdracht verstrekt aan een samenwerkende partner, zoals een hogeschool of universiteit. In het verleden is dit bijvoorbeeld gebeurd bij de volgende organisaties:
Wageningen University & Research in Wageningen
Hogeschool Van Hall Larenstein in Leeuwarden
Katholieke Universiteit Leuven in Leuven, België
Meteo Group in Wageningen
Belgica De Weerd in Breda; drs. Henk de Weerd, duivendierenarts
Hogeschool Utrecht, Instituut Engineering & Design